38-erių ispanas karjerą „Barcelona“ klube pradėjo 1997-aisiais, metams 2007-2008 m. buvo išvykęs į „Memphis Grizzlies“, tačiau tada vėl grįžo į Kataloniją, kur ir žaidė iki karjeros pabaigos.
Gynėjas dukart tapo Eurolygos čempionu, aštuonis kartus triumfavo Ispanijos pirmenybėse, septyniskart į viršų kėlė Ispanijos taurę.
Rezultatyviausias savo rungtynes Eurolygoje J.C.Navarro 2006-aisiais sužaidė prieš Kauno „Žalgirį“. Tada jis pelnė net 32 taškus. Tais pačiais metais ispanas sužaidė ir naudingiausias savo rungtynes, kai surinko 35 naudingumo balus. Tą jis taip pat padarė žaisdamas prieš Kauno „Žalgirį“.
2014-aisiais J.C.Navarro buvo paskelbtas Eurolygos legenda.
Su Ispanijos rinktine veteranas dukart laimėjo Europos čempionatą ir kartą tapo pasaulio čempionu.
