F.San Emeterio karjerą pradėjo prieš du dešimtmečius.
197 cm ūgio krepšininkas atstovavo Valjadolido, Žironos komandoms, o labiausiai atsiskleidė Vitorijos „Baskonia“ klube, kuriame žaidė 2008-2015 metais.
2010-2011 m. sezoną jis rinko po 13,7 taško Eurolygoje ir pagal naudingumą (po 19,1 balo) buvo tarp efektyviausių turnyre. Tą patį sezoną puolėjas buvo pripažintas naudingiausiu Ispanijos lygos žaidėju ir pateko į geriausių Eurolygos žaidėjų penketą.
2015-2021 m. F.San Emeterio rungtyniavo Valensijos klube, su kuriuo 2017 metais laimėjo Ispanijos lygos auksą, o 2019 metais – Europos taurę.
„Vienas svarbiausių Ispanijos žaidėjų per pastaruosius du dešimtmečius, Fernando San Emeterio, nusprendė baigti sportinę karjerą, o viešai tars „sudie“ per ceremoniją penktadienį „La Fonteta“ aikštėje, kurioje žaidė pastaruosius šešerius metus vilkėdamas „Valencia Basket“ marškinėlius“, – paskelbė Valensijos klubas.
Penkis svarbius apdovanojimus F.San Emeterio iškovojo su Ispanijos rinktine.
Jis laimėjo Europos pirmenybių auksą 2011 ir 2015 metais. 2012 metais Londone pelnė olimpinį sidabrą, o dar du Europos čempionatų bronzos medalius iškovojo 2013 ir 2017 metais.
