Niekas iš tikrųjų nežino, kodėl šie miestai buvo apleisti. Vieni mano, kad dėl kruvino mūšio žmonės buvo priversti bėgti, kiti tiki, kad tai lėmė pokyčiai religinėje sistemoje – kchmerų induizmą pakeitė budizmas. Dar viena versija – sudėtinga vandens sistema sugedo, ir žmonės turėjo išsikraustyti ieškodami vandens.
Ankor Vato šventyklų kompleksas buvo visuomet žinomas vietiniams, tačiau ilgą laiką buvo apleistas – jį gerai slėpė supančios džiunglės. Vietiniai vakariečius į ten nuvedė tik 1586 m., tačiau tik XIX a. pabaigoje Europos archeologai pradėjo šia vieta domėtis.
Restauracijos darbus buvo nutraukęs pilietinis karas, tačiau jie pratęsti 1993 m. – po to, kai UNESCO pradėjo galingą kampaniją, šią vietą įvardijusi ir kaip Pasaulio paveldo vietą, ir kaip Pasaulio paveldo vietą, kuriai gresia pavojus.
