Jis gimė 1930 m. liepos 10 d. Šilalėje. 1948–1951 m. Kauno J.Gruodžio muzikos mokykloje mokėsi choro dirigavimo. 1951–1952 m. šias žinias gilino Lietuvos valstybinėje konservatorijoje. 1960 mem. baigė Lietuvos valstybinės konservatorijos kompozicijos klasę pas prof. Julių Juzeliūną. Nuo 1961 m. V.Jurgutis buvo Lietuvos kompozitorių sąjungos narys, ne kartą rinktas į jos valdybą ir tarybą, buvo Muzikos fondo pirmininkas. Nuo 1961 m. Vilniaus pedagoginiame institute (dabar – Lietuvos edukologijos universitetas) dėstė Muzikos teorijos disciplinas, 1969–1974 m. vadovavo Muzikos teorijos katedrai. Nuo 1974 m. Lietuvos valstybinės konservatorijos (dabar Lietuvos muzikos ir teatro akademija) Muzikos teorijos katedros docentas, nuo 1990 m. – profesorius.
V.Jurgutis sukūrė daugiau kaip 100 įvairių žanrų vokalinių ir instrumentinių kūrinių. Jo kūryboje dominuoja stambios kantatinio-oratorinio žanro kompozicijos (kantata „Skambesiai“, vokalinė-instrumentinė poema „Kareivio laiškai“, koncertas smuikui ir kameriniam orkestrui). 1974 m. už oratoriją „Donelaitis“ (J.Marcinkevičiaus žodžiais) apdovanotas Lietuvos valstybine premija, 1980 m. jam suteiktas nusipelniusio meno veikėjo garbės vardas.
1992–1996 m. V.Jurgutis buvo Vilniaus „Vytautų klubo“ prezidentas, iniciavęs mokslinę konferenciją „Vytautas ir Lietuva“, taip pat knygos „Vytautas Didysis ir Lietuva“ parengimą ir išleidimą.
Su žmona Joana Virginija Jurgutiene, ilgamete Lietuvos nacionalinio radijo ir televizijos laidų apie teatrą ir muziką autore, V.Jurgutis užaugino du sūnus, kurie taip pat yra aktyvūs Lietuvos muzikos ir kultūros gyvenimo dalyviai.
Atsisveikinti su velioniu galima Vilniaus arkivyskupijos Laidojimo paslaugų centro salėje prie Šv. Apaštalų Petro ir Povilo bažnyčios (M. Paco g. 4) vasario 25 d., pirmadienį, 16–22 val.; vasario 26 d., antradienį, 8–15.15 val. Laidotuvės įvyks Vilniaus Antakalnio kapinių Menininkų kalnelyje.
Šv. Mišios už velionį bus aukojamos Vilniaus Šv. Apaštalų Petro ir Povilo bažnyčioje vasario 26 d. 7. 30 val.