Tačiau eilėms nestinga ir pilietinio skambesio. Sankt Peterburgo universitete studijuodamas teisę, Vaičaitis gyveno Vasiljevo saloje 11-oje linijoje, nr. 52, viename bute su Antanu Daniliausku. Per kratą 1897 m. rugpjūtį ten rasta lietuvių studentų slapta bibliotekėlė.
Vaičaitis tuomet atostogavo tėviškėje Santakų kaime (Šakių raj.), Daniliauskas savo draugo neišdavė. Tačiau ir Vaičaičių namuose žandarai rado lietuviškų rankraščių, todėl poetui teko visą mėnesį praleisti Kalvarijos kalėjime, metus kęsti ypatingą policijos priežiūrą.
Vis dėlto 1900 m. jam leista grįžti, kad baigtų universitetą, deja, buvo paliktas be stipendijos. Eduardas Volteris surado Vaičaičiui darbą Mokslų akademijos bibliotekoje.