Kaip praneša Krašto apsaugos ministerija, BALTRON junginio laivų pratybos susidės iš dviejų dalių – mokymų krante ir jūroje. Pradžioje karo laivų įgulų nariai mokymo centre Liepojoje naudodamiesi specialiu treniruokliu vykdys kovos už laivo gyvybingumą, gaisro gesinimo, ryšininkų ir vachtos karininkų treniruotes.
Vėliau karo laivai Baltijos jūroje atliks manevravimo, išminavimo, artilerinių šaudymų, šaudymų tamsiuoju paros metu, priešlėktuvinės gynybos, paieškos ir gelbėjimo, laivų aprūpinimo jūroje ir pagalbos avariją patyrusiems laivams teikimo veiksmus, taip pat vykdys laivų stebėjimo ir raportavimo, kitas užduotis.
Šiose pratybose Latvijos karines jūrų pajėgas atstovaus štabo ir aprūpinimo laivas A53 „Virsaitis“, priešmininis laivas M04 „Imanta“, aprūpinimo laivas A90 „Varonis“ ir patrulinis laivas P08 „Jelgava“.
2015 metais BALTRON laivų junginiui Lietuva skiria 2 karininkus – BALTRON junginio štabo viršininko ir štabo karininko pareigoms vykdyti. Taip pat antrą šių metų pusmetį BALTRON junginiui yra priskirtas priešmininis laivas M52 „Sūduvis“.
BALTRON laivų junginio veiklą vykdo Lietuva ir Latvija, o Estija nuo 2015 metų yra priėmusi sprendimą nebeskirti pajėgumų į BALTRON junginį dėl ribotų resursų. Trijų Baltijos valstybių karinės jūrų pajėgos bendrai treniruojasi dalyvaudami NATO nuolatinės parengties priešmininių laivų 1-os grupės junginio (angl. Standing NATO Mine Countermeasures Group One, SNMCMG1) veikloje.