Į pareigas laikinai paskirtas direktoriaus pavaduotoju dirbęs Vaidas Valikonis.
Šiuo metu Seimo Antikorupcijos komisija atlieka parlamentinį tyrimą dėl elektroninės sveikatos sistemos e-sveikata įgyvendinimo. Už šį projektą Registrų centre buvo atsakingas A.Bagdonavičius.
BNS turimi duomenys rodo, kad Registrų centras dar 2014-aisiais vykdė tris pirkimus, juos laimėjo bendrovė „Bull Baltija“, pasirašiusi 1,36 mln. eurų vertės sutartį. Už pirkimus buvo atsakingas A.Bagdonavičius, tuo metu dirbęs Registrų centro direktoriaus pavaduotoju.
Aiškinamasi, ar pirkimų sąlygos, techninės specifikacijos nebuvo parengtos ir pritaikytos vienam tiekėjui.
Dėl šio Seimo komisijos vykdomo tyrimo sustabdytas ir A.Bagdonavičiaus skyrimas į nuolatinio Registrų centro direktoriaus pareigas. Jis vykusiame konkurse į šį postą liko antras, tačiau tapo pagrindiniu kandidatu užimti pareigas, kai iš atrankos pasitraukė ją laimėjęs advokatas Gintautas Bartkus.