Kaip skelbia ministerija, agentūra veiklą pradeda po Pabėgėlių priėmimo centro restruktūrizacijos ir organizacinės formos pakeitimo, siekiant užtikrinti efektyvią užsieniečių priėmimo sistemą ir socialinės įtraukties politiką.
Anot socialinės apsaugos ir darbo ministro Vytauto Šilinsko, pastarieji metai buvo kupini iššūkių migracijos srityje, tad iš naujojo vadovo tikimasi drąsos ir ryžto veikti.