Politikos mokslų doktorantūra Lietuvos karo akademijoje steigiama kaip jungtinė keturių universitetų politikos mokslų doktorantūra, akademijai bendradarbiaujant su Vytauto Didžiojo, Kauno technologijos ir Klaipėdos universitetais. Doktorantūros studijas prižiūri iš devynių mokslininkų sudarytas doktorantūros komitetas. Akademijai šiame komitete atstovauja du Politikos mokslų katedros mokslininkai – prof. Gražina Miniotaitė ir prof. Gediminas Vitkus.
Iki šiol universitetines Politikos mokslų studijas Lietuvos karo akademijoje sudarė dvi pakopos: pirmoji (bakalauro) ir antroji (magistro).