Tiksli vargonų sukūrimo data nėra žinoma. Įvairūs šaltiniai rašo, kad jie mena XVII amžiaus pradžią.
Iki šiol Žemaitijoje sklando posakis „balsingas, kaip Kretingos vargonai“.
„Šis instrumentas ilgą laiką buvo didžiausias ir žymiausias Lietuvoje. Pasakojama, kad pirmą kartą užgrojus, nuo garso susproginėjo bažnyčios skliautai, nuo to laiko jais grodavo tik per didžiąsias šventes, o šiokiadieniais – šešių balsų vargonėliais“, – yra rašiusi Jolanta Klietkutė.
Į Lietuvos išskirtinių pasiekimų knygą šiuo metu siekiama įtraukti ir dar du Kretingoje esančius objektus – aukščiausią medinį altorių Lietuvoje ir aukščiausius kapinių vartus Lietuvoje.