Naujuose akvariumuose, be žuvų, bus galima išvysti ir langustų, omarų, kitų povandeninio pasaulio gyvūnų. Pavyzdžiui, vienas akvariumas bus skirtas upėse gyvenančioms žuvims, kitiems gyvūnams, augalams, turės upėms būdingą povandeninį peizažą.
Jūrų muziejuje taip pat planuojama įrengti edukacines ekspozicijas.
Klaipėdoje įsikūrusio Lietuvos jūrų muziejaus ekspozicijos ir akvariumas nedideliais etapais pradėti rekonstruoti 2007 metais, darbus planuojama pabaigti 2017 metais.