Назначение уполномоченных по госгранице предусмотрено в межправительственном соглашении Литвы и России.
В задачи уполномоченных входят анализ и изучение ситуации на литовско-российской границе, согласование и координирование погранведомств, содействие реализации приоритетных направлений охраны госграницы в таких областях, как борьба с контрабандой оружия, боеприпасов, ценностей, валюты, наркотических, психотропных, радиоактивных и других опасных веществ через госграницу.
Уполномоченные также должны обеспечивать тесное сотрудничество, решать вопросы, связанные с деятельностью всех видов пунктов пересечения границы, бесперебойный обмен информацией, которая нужна для обеспечения нормального функционирования этих пунктов.