Auditoriai konstatavo, kad Valstybės ilgalaikės raidos strategijoje numatytas melioracijos turto privatizavimo iki 2015 metų planas nebus įgyvendintas, nes Žemės ūkio ministerija neparengė visų reikalingų teisės aktų projektų. Todėl valstybei ir toliau neapibrėžtą laiką teks papildoma našta – rūpintis turtu, iš kurio naudos gauna melioruotos žemės sklypų savininkai.
Taip pat nustatyta, kad ministerijos parengtoje 2012–2014 metų Melioracijos programoje išdėstyti vertinimo kriterijai nėra aiškiai išskirti, sudaryti nesilaikant hierarchinio principo, abstraktūs. Nerengiamos metinės programos įgyvendinimo ataskaitos, todėl nėra galimybės vertinti pasiektus programos tikslus.
Melioracijos griovių šiose savivaldybėse apžiūrima mažiau kaip 9 proc., o nušienaujama – iki 5 proc., todėl jų būklė nuolatos blogėja, o melioracijos sistemų efektyvumas mažėja.
Žemės ūkio ministerijai neužtikrinus, kad nuo 2004 metų būtų sukurta ir funkcionuotų grafinė melioruotos žemės ir melioracijos statinių apskaitos duomenų bazė, yra nežinoma viso valstybei priklausančio melioracijos turto būklė, negalima efektyviai planuoti melioracijos darbų. Taip pat nežinomas ir tikslus lėšų poreikis, reikalingas valstybei nuosavybės teise priklausančio melioracijos turto tinkamai priežiūrai. Ministerija nevertino, ar savivaldybės lėšų poreikį melioracijos funkcijai vykdyti apskaičiuoja pagal žemės ūkio ministro patvirtintą metodiką.
Valstybei priklausantį melioracijos turtą pavesta prižiūrėti savivaldybėms. Audito metu nustatyta, kad jos kasmet nušienauja tik apie 2 proc. visų valdomų melioracijos griovių (pagrindinės melioracijos sistemos dalies), o penktadalis savivaldybių griovių iš viso nešienauja. Audito metu vertintose Alytaus, Pasvalio, Šilutės ir Vilkaviškio rajonų savivaldybėse per metus melioracijos specialistai apžiūri ir įvertina mažiau kaip 7 proc. drenažu nusausintos žemės būklę. Melioracijos griovių šiose savivaldybėse apžiūrima mažiau kaip 9 proc., o nušienaujama – iki 5 proc., todėl jų būklė nuolatos blogėja, o melioracijos sistemų efektyvumas mažėja.
Valstybės kontrolė Žemės ūkio ministerijai pateikė rekomendacijas, padėsiančias formuoti efektyvesnę valstybės politiką melioracijos srityje, įgyvendinti turto pertvarką ir mažinti valstybei tenkančią melioracijos turto priežiūros naštą.