Panaudojant lėšas labiausiai buvo klystama Kaimo plėtros, aplinkos, žuvininkystės ir sveikatos politikos srityse, kur 7,7 proc. lėšų buvo panaudotos neteisingai ar neteisėtai. Kita sritis, kurioje daug pažeidimų – Regioninė, energetikos ir transporto politika. Čia tokios išlaidos siekė 6,0 proc. Nustatyta, kad visose atskirai patikrintose ES išlaidų srityse, išskyrus Išorės santykių, pagalbos ir plėtros bei Administracinių išlaidų sritis, reikšminga dalis lėšų panaudota pažeidžiant teisės aktus.
Europos Komisijos ir valstybių narių kontrolės sistemos buvo efektyvios tik iš dalies, nes beveik kas antrame auditorių patikrintame mokėjime iš ES biudžeto nustatyti teisės aktų pažeidimai. Pasak Europos Audito Rūmų narės Rasos Budbergytės, nors ES kontekste Lietuva atrodo gerai, tačiau kaip ir kitose šalyse, aktualia problema ir toliau išlieka viešųjų pirkimų taisyklių pažeidimai.