Kaip skelbia „Lietuvos žinios“, 1988 metais įkurtame muziejuje per artimiausius mėnesius muziejuje ketinama atlikti remonto darbus bei įdiegti novatoriškas edukacines priemones, atnaujinti ekspozicijas. Muziejaus direktorius Jonas Genys sako, kad daugiau nei pusė ekspozicijų nekeista 15-20 metų, o patalpoms buvo būtinas remontas. Ekspozicijų atnaujinimui ir remontui ketinama skirti per 230 tūkst. eurų.
Muziejus yra vienas lankomiausių turistų (ypač – vokiečių) objektų bei svarbiausias šio krašto istorijos pažinimo šaltinis, kuriame sukaupta per 100 tūkst. eksponatų, apimančių laikotarpį nuo akmens amžiaus iki mūsų dienų. Mažosios Lietuvos istorijos muziejui taip pat priklauso Pilies, Kalvystės muziejai bei Rezistencijos ir tremties ekspozicija. Kitąmet duris turėtu atverti ir naujas Antrojo pasaulinio karo laikų muziejus „39-45“.