1965 m. kovo 17 dieną per KGB kariuomenės operaciją A. Kraujelis nusišovė, prieš tai sunaikinęs partizanų dokumentus. Iki šiol nežinoma jo palaikų vieta. Atkūrus nepriklausomybę, A. Kraujelis pripažintas kariu savanoriu; jam suteiktas vyr. leitenanto laipsnis, po mirties apdovanotas Vyčio kryžiaus 3-iojo laipsnio ordinu.
„Jis buvo karys, tas karys, kuris iki paskutinės savo gyvenimo minutės laikėsi duotos priesaikos. Tai jis turi būti mums ir mūsų jaunimui pavyzdžiu, kaip žmogus, įsipareigojęs ginti tėvynę, išėjęs labai jaunas į partizanų gretas iki pat gyvenimo pabaigos, o 17 metų būti vienišam kovotojui tai nebuvo lengva. Jis išlaikė partizano statusą“, – sako Gyventojų genocido ir rezistencijos tyrimo centro vadovė Birutė Burauskaitė.