Pagal nustatytą tvarką asmenų vakcinavimą Lietuvos kariuomenėje organizuoja Logistikos valdyboje sukurtas Vakcinacijos operacijų centras, o vykdo Logistikos valdybos Dr. J. Basanavičiaus karo medicinos tarnybos medikai devyniose pagrindinėse Lietuvos kariuomenės įgulose – Rukloje, Panevėžyje, Alytuje, Marijampolėje, Tauragėje, Vilniuje, Klaipėdoje, Kaune ir Šiauliuose.
Vakcinacijos procesą koordinuojantys kariai, vadovaudamiesi tvarkos nuostatomis, apibendrina norinčių skiepytis karių, valstybės tarnautojų ir darbuotojų, dirbančių pagal darbo sutartis, skiepijimui pateiktą būtiną informaciją, užtikrina, kad į sąrašus nebūtų įtraukti vakcinuotis negalintys asmenys (pavyzdžiui, kitoje gydymo įstaigoje 1-ąja vakcinos doze paskiepyti asmenys, sergantys ar persirgę COVID-19 liga, izoliuoti dėl aukštos rizikos kontakto su sergančiu COVID-219 liga ir kt.) bei suderina vakcinacijos laiką ir vietą, bei informuoja skiepytis norinčius asmenis, kur ir kada jiems atvykti.
Vieni pirmųjų nuo koronaviruso paskiepyti Karinėse jūrų pajėgose ir Lietuvos didžiojo kunigaikščio Vytenio bendrosios paramos logistikos batalione tarnaujantys kariai. Pirmieji paskiepyti kariai į prasidėjusią vakcinaciją žvelgia pozityviai, suprasdami nūdienos būtinybę apsaugoti save ir visuomenę nuo pandemijos keliamos grėsmės.
Vakcinacijos tvarkoje nustatyta, kad asmenys, kurie atsisako skiepytis, pakartotinai į skiepijamų sąrašus neįtraukiami – jei vėliau persigalvotų ir pareikštų norą skiepytis, jie būtų vakcinuojami savivaldybių vakcinacijos centruose prasidėjus visų gyventojų vakcinacijai.
Lietuvos kariuomenė prisideda prie koronaviruso suvaldymo ir valstybėje. Šiuo metu teikiama pagalbą SAM ir kariuomenės transportu gabenamos vakcinavimui skirtos priemonės į gydymo įstaigas. Per visą pagalbos laikotarpį kariai skiepijimui reikalingomis priemonėmis padeda aprūpinti daugiau nei 60 sveikatos priežiūros įstaigų visoje Lietuvoje.