Už pavyzdingą pareigų atlikimą muitinės pareigūnus ir darbuotojus apdovanos Muitinės departamento generalinio direktoriaus pavaduotoja, atliekanti generalinio direktoriaus funkcijas, Ramutė Liupkevičienė.
1990 metų spalio 9 dieną Aukščiausioji Taryba priėmė Muitinės laikinąjį įstatymą. Dar po kelių dienų įsteigtas Muitinės departamentas. Per pirmuosius mėnesius jame įdarbinta 30 darbuotojų. Per pirmąjį veiklos pusmetį įkurta 15 muitinių, 1991 metų pradžioje muitinėje jau dirbo 431 asmuo.
Per pastaruosius 15 metų muitininkų konfiskuotų cigarečių pakeliais (beveik 60 milijonų) būtų galima 17 kartų nukloti kelią nuo Vilniaus iki Klaipėdos.
Tuo metu tai buvo pavojinga tarnyba. Pasienyje sustatytuose statybininkų vagonėliuose dirbę pareigūnai nuolat buvo užpuolami: sovietų kariai mušdavo muitininkus, grasindavo ginklais, stengėsi įbauginti ir priversti netarnauti muitinėje. 1991 metų liepos 31-osios naktį Medininkų kelio poste žuvo septyni pasienyje dirbę pareigūnai – muitininkai bei policininkai. Sunkiai sužeistas muitininkas Tomas Šernas išgyveno.
Muitinės departamento teigimu, muitinės veikla visais laikais buvo neatsiejama nuo kovos su kontrabanda – per pastaruosius 15 metų muitininkų konfiskuotų cigarečių pakeliais (beveik 60 milijonų) būtų galima 17 kartų nukloti kelią nuo Vilniaus iki Klaipėdos. Likviduota nelegalių cigarečių ir alkoholio fabrikų visoje Lietuvoje, aptikta ginklų, sulaikyta 3,5 tonos narkotinių ir psichotropinių medžiagų, daugiau kaip milijonas klastotų prekių, tūkstančiai klastotų eurų ir dolerių.
Šiuo metu muitinėje dirba 2 359 pareigūnai ir darbuotojai. Vidutiniškai per parą per valstybės sieną pravažiuoja daugiau nei 1 000 krovininių automobilių, 85 autobusai ir beveik 2 000 lengvųjų automobilių.
2014 metais įformintos 250 tūkst. importo ir 532 tūkst. eksporto deklaracijų. 99 proc. deklaracijų įforminta elektroniniu būdu. Pernai taip pat muitinėje įforminta beveik 1,2 mln. tranzito procedūrų.
