Tarnybą vidaus reikalų sistemoje Marius Vaičikauskas pradėjo 1992 m. sausį Klaipėdos miesto 3-ajme PK, Savivaldybių policijoje, policininku stažuotoju.
2015 m. balandį tapo Rietavo PK viršininku ir šiose pareigose dirbo iki šiol.
Marius Vaičikauskas yra ne kartą skatintas už nuopelnus ir nepriekaištingą tarnybą, nacionaliniuose Lietuvos policijos konkursuose yra iškovojęs geriausio Viešosios policijos pareigūno vardą.