Vadovauti aukštajai mokyklai siekia šio universiteto Bankininkystės ir investicijų katedroje dėstantis docentas daktaras Marius Lanskoronskis, MRU Senato narys, Politikos ir vadybos fakulteto dekanas docentas daktaras Algirdas Monkevičius, buvęs Mykolo Romerio universiteto Socialinės informatikos fakulteto dekanas daktaras Saulius Norvaišas, kuris taip pat nesėkmingai siekė Vilniaus universiteto rektoriaus posto, bei buvęs Seimo narys daktaras Mantas Varaška.
Kandidatų sąrašą penktadienį paskelbė MRU rektoriaus rinkimus viešo konkurso būdu organizuotanti komisija.
Šiuo metu laikimai universiteto rektoriaus pareigas eina profesorius daktaras Alvydas Pumputis.