1993 m. balandžio 5 d. Generalinėje prokuratūroje buvo įsteigtas Kovos su organizuotu nusikalstamumu skyrius (vėliau departamentas).
Šiam skyriui ėmė vadovauti tuometinis Nusikaltimų tyrimo departamento prie Lietuvos Respublikos generalinės prokuratūros Kauno skyriaus vyriausiasis tardytojas Algimantas Kliunka.