„Tūkstantmečio mokyklos“ programa – švietimo sistemos programa, kurios vizija – kiekvienas Lietuvos vaikas turi galimybę mokytis šiuolaikiškoje ir atviroje mokykloje. Ja siekiama mažinti mokinių pasiekimų atotrūkius ir sukurti kokybiškas ugdymosi sąlygas kiekvienoje savivaldybėje.