Tam numatoma pertvarkyti Ignalinos AE, Radioaktyviųjų atliekų tvarkymo agentūrą, Energetikos agentūrą, Ignalinos atominės elektrinės regiono plėtros agentūrą ir Centrinę projektų valdymo agentūrą.
„Numatoma, kad agentūra veiktų dvejose pagrindinėse srityse: pirmoji būtų susijusi su Ignalinos AE eksploatavimo nutraukimo procesais, o antroji apimtų visų Lietuvos Respublikoje susidarančių radioaktyviųjų atliekų tvarkymą“, -rašoma ministerijos viešam svarstymui pateiktame Vyriausybės nutarimo projekte.
Numatoma, kad agentūra pradėtų veikti 2014 metų pirmąjį ketvirtį.
Pertvarka siekiama tinkamai vykdyti įsipareigojimus Europos Sąjungai dėl Ignalinos AE uždarymo.