2017 metais pirmajam savo bendrovės „Shift4“ padaliniui už JAV ribų J. Isaacmanas pasirinko Vilnių – čia veikia jos padalinys „Shift4 Payments Lithuania“. „Shift4“ vysto atsiskaitymo prekybos vietose sprendimus, bet Lietuvoje pamatyti jų tikimybės praktiškai nėra, nes pagrindinė „Shift4“ rinka yra JAV.
J. Isaacmanas daug kartų yra buvęs Lietuvoje. 2021 metais jis netgi tapo „Globalios Lietuvos apdovanojimų“ laureatu, verslininkui buvo skirtas pripažinimas už tai, kad į ribotą daiktų, kuriuos galėjo pasiimti į kosmosą sąrašą, įtraukė ir kosmose iškėlė Lietuvos vėliavą.
